在藏地人們共稱有三大文殊，即格魯派的宗喀巴大師，薩迦派的薩迦班智達根嘎嘉村，寧瑪派的全知無垢光尊者。法王以他那不可言說的修持力一一面見文殊三大化身的尊顏，並在他們面前聆聽法要傳承，獲得灌頂加持。
當年在石渠求學初學因明《量理寶藏論》時，對其中有些深奧的因明密語略微覺得難懂，就一緣專注猛勵祈禱上師本尊。一天晚上光明夢境中，薩迦班智達顯現，為他傳授了一遍《真實名經》並賜予殊勝加持。醒來以後，對顯密一切法要無所不知，尤其是因明的所有問題全部迎刃而解。一直睡了兩三天，醒來後他異常興奮，喃喃地說：“我病了。”
1981年（木雞年）的冬季，在為學院數以千計的弟子傳授《大幻化網》密續期間，也是屢次出現吉兆瑞相。一日，法王在寢室中閉目沉思，驀然間，睜開雙目，只見五彩斑斕的光芒中，全知無垢光尊者與益西措嘉佛母飄然降落，賜予他《大幻化網》甚深灌頂，完畢後騰空而起，不多時便杳無蹤影了。法王欣喜之餘立即將灌頂儀軌全部記錄下來，現收集於他的作品中。如今法王為海內外弟眾賜此灌頂所用的均是此儀軌。
1986年（火虎年）7月20日，法王安閒地坐在床榻上，突然間眼前掠過一道刺眼的白光，接著一位頭帶班智達黃色長耳帽、身著三衣、面如冠玉的大士降臨在面前。他馬上認出這位尊者是宗喀巴大師，於是上前見禮。大師為他傳授了一遍《三主要道論》後微笑著說：“我今在至尊彌勒菩薩座下名為文殊藏，如今你的弟子中如若有人背誦我的《三主要道論》法要，受持八關齋戒，以法性力的加持，暫時一定可以轉生到兜率天享受法樂，將來我成佛為獅子吼如來時，成為我的首座眷屬。”說罷化光而逝。法王將此次面見宗喀巴大師的情景講述給弟眾們聽後，道孚、爐霍等地格魯派的大格西、僧人們紛紛前來他座下求法。遵照宗喀巴大師所說，弟子中背誦《三主要道論》、守持淨戒的人與日俱增、不可勝數。
因為法王曾親自面見了各派的教主，致使如今藏傳佛教中鼎足而立的格魯、薩迦、寧瑪等各大教派友好團結，關係十分融洽。
