琉球群島

琉球群島又稱為琉球列島，位於台灣島與九州島之間，為大隅群島、吐噶喇群島、奄美群島、沖繩群島、宮古群島、八重山群島等太平洋西部島嶼群的合稱。

日本認為琉球群島自古以來就是日本的一部份，加上二戰結束後由美軍佔領沖繩，由於為了防止共產主義擴張，便將琉球群島主權交給當時屬於美國陣營的日本。目前，日本也將琉球群島的行政區劃屬於沖繩縣和鹿兒島縣。

不過，在二戰後也有部分琉球人要求琉球獨立建國，「琉球復國運動」相關組織至今仍然存在，只是琉球群島經過日本政府三十餘年的統治，加上大量日本本土移民琉球群島，現在沖繩人（琉球人）多數對日本的國家認同較強，支持獨立運動的人並不多。

中華民國政府方面則認為日本政府接受「波茨坦公告」時便失去對琉球群島的主權，應支持琉球為獨立國家，或者判定由其擁有琉球群島的主權，所以至今仍未正式承認日本擁有琉球群島，而中華人民共和國政府也未曾承認過日本的主張。
 
 

釣魚台列嶼

釣魚台列嶼是位於東海南部、台灣東北部、中國琉球界溝西北側、琉球沖繩諸島以西、八重山列島以北的島群，各島均為無人島。釣魚台列嶼最晚在明朝就被發現以及使用，20世紀初期由日本控制，在第二次世界大戰後由美國佔領，並在隨後的1972年，由美國將琉球群島及釣魚台列嶼的行政管轄權一併移交日本，因而引發一系列的主權問題。

中華民國與中華人民共和國的主張大致相同，均認為從明清時朝對釣魚台列嶼已有實質控制，並且歸劃為台灣附屬島嶼；雖然並未在《馬關條約》中一一列舉，但當時割讓給日本者自然包括釣魚台列嶼在內。所以，按照二戰後《馬關條約》的廢除，釣魚台列嶼應與台灣和澎湖列島等一同歸還中國。

日本則認為清朝時期中國並未對釣魚島有主權宣示行為，所以日本可基於無主地先佔的法理取得主權。而即使釣魚台列嶼是清朝的故有領土，《馬關條約》中割讓的部份也不包括在內；且在1895年到1971年間，中華民國及中華人民共和國對日本控制釣魚台列嶼的事實從未表示過反對，所以也能視為領土的轉讓。
 

 
南海
南海位於東南亞的陸緣海，被中國大陸、台灣本島、菲律賓群島、馬來群島及中印半島所環繞，有超過200個無人居住的島嶼和岩礁，合稱為南海諸島，主要分為中沙、東沙、西沙和南沙四大群島。由於初步估算海底石油蘊藏量達二百億噸，目前中華民國、汶萊、馬來西亞、菲律賓和越南、中華人民共和國等國家均宣稱對南海諸島或部分島嶼擁有主權。

中沙群島
除了黃岩島，中沙群島大部分是沒有露出水面的珊瑚礁石，由於鄰近海域航行困難而沒有駐軍和居民。中華人民共和國、中華民國及菲律賓皆聲稱擁有中沙群島的主權，但目前是由中華人民共和國政府實際控制，行政上由海南省三沙市管轄；中華民國將其則劃為高雄市旗津區；菲律賓則由三描禮士省管理。

在今年的4月10日，該地發生了「中菲黃岩島事件」，由於菲律賓海軍在黃岩島海域欲抓捕中國漁船上的漁民，而引起中國漁政船與菲律賓海軍護衛艦的對峙，目前仍在進行當中。
 
西沙群島
西沙群島主體由永樂群島和宣德群島組成，中華人民共和國、中華民國和越南皆聲稱擁有主權，實際則由中華人民共和國政府控制，劃歸海南省三沙市管轄，並有三沙市人民政府駐其中的永興島。
 
南沙群島
南海諸島中島礁最多、分布最廣的群島，由230多個島、洲、礁、沙和灘組成，目前已定名的島嶼約有192個。中華民國、中華人民共和國與越南三方皆聲稱擁有完整主權，馬來西亞和菲律賓則宣稱擁有部分島嶼主權，並有部署軍力來確保自身權益，而汶萊與印度尼西亞則是宣稱擁有此區海域的主權。目前中華民國實際控制的有太平島和中洲礁。

東沙群島
東沙群島目前無常住人口，是由中華民國控制，劃歸為高雄市旗津區中興里，有海巡署官兵常態駐守，中華民國政府亦於此成立東沙環礁國家公園，是臺灣總面積最大的國家公園，但為了生態保育並不開放觀光。另外，中華人民共和國也宣稱擁有該群島主權，並規屬於廣東省汕尾市陸豐市碣石鎮。